本系大學部旨在培育國小階段特殊教育師資，藉由相關理論及實務課程，充實本系學生專業能力，以因應未來教學生涯的需求。
（一）培育國小階段特殊教育師資：以培養國小階段特殊教育師資及辦理特教師資之在職教育為重點，並整合校內既有學術資源，使未來培育之畢業生除了能勝任教學工作之外，並且擁有獨立思考解決問題及終生學習之能力。
（二）課程規劃完備：本系課程計有通識課程、專業教育課程、專業課程及自由選修。除在正式課程加強各項專業知識及能力的培育，更重視教育實習，以增進理論與實務間的結合與驗證。
（三）教學設備充實：本系目前有系圖書室，結合本校圖書館國內外特教相關期刊及資料庫，亦有電腦及輔助科技、各式測驗工具、知動訓練器材、特教觀察室、專科教室及碩士班研究室等設備，培養蒐集資料與運用科技的能力。
（四）與國內各公私立醫療、教育、養護機構密切聯繫：增加學生臨床經驗，並培養與其他專業領域合作的能力。

碩士班（含在職專班）則著重以下五點：
（一） 培養特殊教育學術研究及服務與推廣等專兼人員。
（二） 促進特殊教育與普通教育的交流，為融合教育儲備人才。
（三） 協助臺東地區特殊教育學校成立，發展專業團隊的規劃。
（四） 整合臺東地區特殊教育資源，成立有組織有效能的專業團隊運作小組。
（五） 提升特殊教育教學品質，落實個別化教育計劃。